物理与电子工程学院成立于2004年7月，前身是广州大学理学院物理与电子信息系。广州大学理学院物理与电子信息系是 2001年7月由原广州师范学院物理系、原广州教育学院（原广州师范专科学校）物理系以及原广州大学、原华建西基础部物理教研室组建而成。2004年7月，广州大学理学院拆分为数学与信息工程学院、物理与电子工程学院、地理科学与学院。物理与电子工程学院地址于2005年8月由广州市解放北路桂花岗东一号移到广州市大学城外环西路230号。
（原）广州师范学院物理系的历任系主任、系书记
1986-1990 黄卓和 教授 系主任
许宗籓 党总支书记
1990-1994 黄卓和 教授 系主任
郭勇 党总支书记
1994-1996 黄卓和 教授 系主任
李遂伦 党总支副书记
1996-1997 陈传誉 教授 系主任
李遂伦 党总支副书记
1997-1998 李训贵 教授 系主任
蔡建春 党总支书记
1998-2001 解文方 教授 系主任
蔡建春 党总支书记
（原）广州教育学院物理系的历任系主任、系书记
1987-1990 钟定世 教授 系主任
潘持锐 党总支书记
1990-1995 梁学勤 教授 系主任
潘持锐 党总支书记
1995-2000 尤 华 教授 系主任
姚敏华 党总支书记
余连德 副教授 系主任
广州大学理学院 物理与电子信息系历任主任、书记
2001-2004 解文方 教授 理学院副院长
2001-2004 郭康贤 教授 系主任
蔡建春 党总支书记
广州大学物理与电子工程学院的历任院长、书记
第一届：2004.7-2007.6
樊军辉 教授 院长
蔡建春 党委书记
郭康贤 教授 副院长
皮飞鹏 副教授 副院长
李春颖 党委副书记
徐 伟 教授 院长助理
第二届：2007.6-2011.6
樊军辉 教授 院长
蔡建春 党委书记 （2010.12退休）
陈 筠 党委书记（2011.1任职）
郭康贤 教授 副院长
皮飞鹏 副教授 副院长
徐 伟 教授 副院长
李春颖 党委副书记（2008.5退休）
卢国潜 党委副书记（2008.7任职）
张靖仪 教授 院长助理
第三届：2011.6至今
樊军辉 教授 院长
陈 筠 党委书记
皮飞鹏 副教授 副院长
徐 伟 教授 副院长（2015.3免职）
张靖仪 教授 副院长
卢国潜 党委副书记
陈 渊 教授 院长助理
罗高涌 教授 院长助理（2015.4任职）
附：
原广州师范学院
1958年，为适应工农业生产迅速发展急需师资的需要，广东于1958年8月正式成立广州师范学院，隶属广州市委领导。
1961年8月，中共广东省委决定，广州师范学院与广东师范学院合并，归由市委、市人委领导。1961年9月1日前，两校初步完成合并工作，校名仍用广东师范学院，属全日制高等师范学校，省重点高校之一。
1962年7月起，停止招生，规模逐渐缩小。
1964年7月，根据上级指示，调整停办下马。
1978年12月，教育部下文同意广州师范学院复办，1979年2月，市革委会正式发出通知，广州师院归口广州市文化教办公室，按局级单位管理。
1986年8月，广州师院按广州地区省属全日制本科高等院校同等规模和待遇，列为厅级单位。
1993年4月，广州师院经市委、市政府批准，扩大办学规模，由2000名本科生扩大到4000名本科生
原广州大学
1983年4月，广东成立广州职业大学，学校属短期、职业性大学专科，学制文科2年、工科3年，不包分配。是年10月，定名为“广州大学”，校长叶选平。
1987年6月，广州大学定为副厅级建制。
原广州教育学院
1953年，广州市教师业余进修学院创办。是年定名为广州教育学院，是一所以培养在职中学教师和教育行政干部为主的高等院校。
原广州高等师范专科学校
1985年，为适应广州市普及九年制义务教育的需要，广州市政府决定依托广州教育学院创办广州高等师范专科学校，实行一套人马两块牌子办学，融培养与培训于一体。
原华南建设学院（西院）
1986年5月，广州市政府决定，在广州市城建职工大学的基础上筹建广州城市建设学院。
1987年1月，国家教委批准筹建广州城市建设学院，由广州市建委负责投资办学。
1991年6月，经国家教委批准，广东省建筑工程专科学校与广州城市建设学院（筹）联合办学，成立华南建设学院。原广东省建设工程专科学校为华南建设学院东院，隶属广东省建委；原广州城市建设学院（筹）为华南建设学院西院，隶属广州市建委，广州市副市长戴治国兼任学院院长。同年9月，华南建设学院西院开始对外招收本科生。
1995年4月，经广东省学位委员会评审通过，华南建设学院西院成为学士学位授予单位。 1995年，华南建设学院东院与广东工学院、广东机械学院合并组建广东工业大学。华南建设学院西院继续独立办学，挂靠广东工业大学招生。